Berdasarkan Surat Keputusan Rektor Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” Yogyakarta No: 481/UN62/II/2016, tentang 
LOGO Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” ditetapkan lambang Universitas Pembangunan Nasional "Veteran" Yogyakarta 
dengan bentuk dan makna sebagai berikut:
a.  Berbentuk persegi lima cembung dengan warna dasar kuning dengan kode warna 255-255-0.
      Mengandung makna: Senantiasa dapat mengikuti perkembangan tuntutan zaman dalam kiprahnya di        dunia pendidikan  sekaligus sebagai pengawal, pendukung dan pengikut seluruh makna yang                    terkandung di dalam logo UPN “Veteran” Yogyakarta.

b.  Bunga melati berwarna putih dengan kode warna 255-255-255 yang sedang mekar dengan dua kelopak yang telah mekar. Mengandung makna:
    1)    Sebagai lambang kepribadian bangsa yang suci, bersih dan agung serta harum merebak sepanjang masa.
    2)    Lima kelopak bunga yang menguncup bersatu, melambangkan kejiwaan Pancasila.
    3)    Dua kelopak bunga yang terbuka, melambangkan penuntutan ilmu serta membaktikan diri kepada masyarakat.

c.  Nyala api yang berkobar di kiri kanan
    Mengandung Makna: Melambangkan semangat yang tinggi dan pantang menyerah serta kemauan yang menyala-nyala 
    guna mencapai tujuan.

d.  Tumpuan nyala api berteras tiga warna hitam dengan kode warna 0-0-0
    Mengandung makna: Melambangkan Tridarma Perguruan Tinggi

e.  Pita berwarna putih dengan kode warna 255-255-255 dengan sesanti “WIDYA MWAT YASA’’
    Mengandung makna: Menuntut ilmu untuk didarmabaktikan bagi pembangunan bangsa dan negara.

f.  Topi Baja berwarna hijau dengan kode warna 0-135-50 berbintang satu bersudut lima berwarna kuning 
    dengan kode warna 255-255-0.
    Mengandung makna: Melambangkan perwujudan dari UPN “Veteran” Yogyakarta sebagai monumen aktif Veteran RI serta upaya pewarisan nilai-nilai 45 kepada generasi muda.

g.  Tulisan melingkar Universitas Pembangunan Nasional “Veteran” Yogyakarta.
    Mengandung makna: Sebagai suatu Perguruan Tinggi, UPN “Veteran” merupakan suatu tempat pendadaran kader-kader dengan tujuan di kemudian hari mengamal baktikan ilmunya demi kepentingan dan kemajuan bangsa dan negara Indonesia.